是我国唯一反映古代中外海上交通历史的专门性博物馆，创建于1959年，旧馆位于开元寺内，新馆坐落在东湖公园东侧，共有“泉州港与古代海外交通陈列馆”、“泉州宗教石刻陈列馆”和“泉州湾古船陈列馆”三个专题馆。
    海外交通陈列馆展示了两千多年来泉州的海事活动以及明清时期郑和下西洋、华侨出国、经商贸易、信仰与民俗的交融等历史事实。
    宗教石刻陈列分伊斯兰教、古基督教、印度教、摩尼教四个部分。以伊斯兰教遗物最为突出，其数量之多、内容之丰富居全国第一。 位于开元寺内的古船陈列馆展出了1974年出土的一艘13世纪建造的福建远洋木帆船，船舱出土的遗物有香料、药材、木货牌(签)、铜铁钱、陶瓷器等14类。