南麂岛冬暖夏凉，年平均温度为16.5℃，历来为避暑胜地。每年6～9月为旅游旺季，7、8月尤为热闹。夏日夜晚的南麂岛，海风很大，极凉爽，可以不用空调。
　　不过岛上的气温非常不稳定，夏日还会遭遇台风。若风力超过9级，航班就会取消，造成游客进出两难，出发前一定要关注一下当地的天气预报。